Σήμερα συνδιοργανωτές του μίτινγκ είναι ο Μεσσηνιακός Γ.Σ., Ο Δήμος Καλαμάτας και η Νομαρχία Μεσσηνίας. Το όνομα δόθηκε προς τιμήν του Μεσσηνίου ήρωα της Επανάστασης του 1821 Παπαφλέσσα και σε ανάμνηση της θυσίας του στο Μανιάκι Μεσσηνίας.
Τα Παπαφλέσσεια ξεκίνησαν στα μέσα της δεκαετίας 1950-60 ως ετήσιοι τοπικοί αγώνες στίβου και αποτελούν την μετεξέλιξη της προπολεμικής αθλητικής διοργάνωσης΄΄Ελευθερία΄΄. Μετείχαν Μεσσήνιοι αθλητές και διεξάγονταν στο γήπεδο του Μεσσηνιακού Γ.Σ. Οι αγώνες ήταν πολύ δημοφιλείς. Συνεχίστηκαν ως το 1968 και στο πρόγραμμά τους περιλαμβάνονταν τα αγωνίσματα:100,200,400,1500,3000,4Χ100,μήκος,ύψος,τριπλούν επί κοντώ, μήκος χωρίς φορά και σφαίρα
Μετά από διακοπή αναβίωσαν το 1984 χρονιά που τοποθετήθηκε ελαστικός τάπητας στο Δημοτικό Στάδιο Καλαμάτας. Ως το 1995 είχαν αποκλειστικά ελληνικό χαρακτήρα.
Το 1996 ξεκινά η διεθνοποίηση των Παπαφλεσσείων με τη συμμετοχή των καλύτερων Ελλήνων και ξένων αθλητών. Επιτυγχάνονται εντυπωσιακές αποδόσεις. Η διοργάνωση τελεί υπό την αιγίδα του ΣΕΓΑΣ και της Ευρωπαϊκής Ομοσπονδίας Αθλητισμού.
Τα σπουδαιότερα ελληνικά ρεκόρ αγώνων στα Παπαφλέσσεια είναι τα εξής:
1. Μήκος: Λούης Τσάτουμας: 8,66μ:2007
2. Ακόντιο: Κώστας Γκατσιούδης: 88,76μ:2000
3. 100μ: Κατερίνα Θάνου: 10.91:1999
4. 400μ.εμπ.: Φανή Χαλκιά: 54.66:2006
Τα Παπαφλέσσεια μπορούν να συμβάλλουν και αυτά με τη σειρά τους στην ανάδειξη της Καλαμάτας ως πολιτιστική πρωτεύουσα της Ευρώπης για το 2021".
Άγγελος Τσώνης