Αναλυτικά ο τρόπος διεξαγωγής, σύμφωνα με την προκήρυξη, είναι:

Α’ Φάση 

"Το σύστημα διεξαγωγής της Α’ Φάσης του Πανελληνίου Πρωταθλήματος Παίδων – Κορασίδων θα καθοριστεί με τις Ειδικές Προκηρύξεις της κάθε Ένωσης/Τ.Ε. με χρονικό διάστημα  από 8/10/2016 έως 9/4/2017 για τους παίδες και από 8/10/2016 έως 9/4/2017  για τις κορασίδες.

Εφιστάται η προσοχή στις Ενώσεις/Τ.Ε. να γίνει ο κατάλληλος προγραμματισμός ώστε να τελειώσουν έγκαιρα οι αγώνες της Α’ Φάσης. Επίσης, παρακαλούνται οι Ενώσεις/Τ.Ε. κατά την προετοιμασία τους συστήματος διεξαγωγής να καταβάλουν κάθε δυνατή προσπάθεια ώστε να διασφαλιστεί ο μεγαλύτερος κατά το δυνατόν αριθμός αγώνων ανά σωματείο καθώς και η διάρκεια των αγώνων ακόμα και για τα σωματεία που δεν θα προκριθούν σε επόμενη φάση της Α’ Φάσης προκειμένου να διασφαλιστεί η συμμετοχή των αθλητών/τριών σε αγώνες για όσο το δυνατόν μεγαλύτερο χρονικό διάστημα είναι αυτό εφικτό.  

Β’ Φάση

"Θα προκριθούν δέκα έξι ομάδες ως εξής: 

Παίδων 

α) οι ομάδες που κατέλαβαν στην Α’ Φάση την 1η θέση στο αντίστοιχο πρωτάθλημα.

β) λαμβάνοντας υπόψη τις εκπροσωπήσεις των Ενώσεων/Τ.Ε. στην Τελική Φάση των αντίστοιχου Πανελλήνιου Πρωταθλήματος 2015-2016, οι ομάδες που θα καταλάβουν την 2η θέση στο αντίστοιχο πρωτάθλημα της ΕΣΠΕΔΑ και της ΕΣΠΕ Πελοποννήσου.

γ) από την Ένωση/Περιφέρεια με τον μεγαλύτερο αριθμό συμμετοχών σωματείων που θα συμμετάσχουν στο αντίστοιχο πρωτάθλημα  η ομάδα που θα καταλάβει τη 2η θέση ή την 3η θέση (εάν είναι από την ΕΣΠΕΔΑ ή την ΕΣΠΕ Πελοποννήσου).

Κορασίδων 

α) οι ομάδες που κατέλαβαν στην Α’ Φάση την 1η θέση στο αντίστοιχο πρωτάθλημα της ΕΣΠΑΑΑ, της ΕΣΠΕΔΑ, της ΕΠΕΣ Θεσ/νίκης, της ΕΣΠΕ Θράκης/Ανατ.Μακεδονίας, της ΕΣΠΕ Μακεδονίας, της ΕΣΠΕ Δυτ. Ελλάδας, της ΕΣΠΕ Κεντρ. Ελλάδας, της ΕΣΠΕ Πελοποννήσου, της ΕΣΠΕ Κρήτης και της Ζ’ Περιφέρειας (10 ομάδες)

Σε περίπτωση που ομάδα που έχει προκριθεί, όπως παραπάνω, δεν δηλώσει συμμετοχή, τότε τη θέση της καταλαμβάνει η ομάδα που τερμάτισε στην υψηλότερη θέση μεταξύ των ομάδων που δεν προκρίθηκαν στην Β’ Φάση από το αντίστοιχο πρωτάθλημα της Ένωσης/Περιφέρειας.  

Χρόνος διεξαγωγής: Παίδων από 27/4/2017 έως 14/5/2017. Κορασίδων από 27/4/2017 έως 14/5/2017.

Στο Πανελλήνιο Πρωτάθλημα Παίδων και Κορασίδων αγωνιστικής περιόδου  2016-2017 θα μπορούν να πάρουν μέρος αθλητές που γεννήθηκαν από 1.1.2000 μέχρι 31.12.2004 και αθλήτριες που γεννήθηκαν από 1.1.2000 μέχρι 31.12.2003".