Εντεκα αναμετρήσεις θα διεξαχθούν την προσεχή Τετάρτη 13 Σεπτεμβρίου και δύο ματς θα γίνουν την Κυριακή 17 του μήνα.

Στη φάση αυτή συμμετέχουν και οι ομάδες της Super League 2, με τους αγώνες να είναι νοκ άουτ.
Η Καλαμάτα ως γνωστόν πέρασε άνευ αγώνα από αυτή τη φάση, όπως και οι
Διαγόρας, Μικρασιατικός, Πιερικός, Αλμωπός Αριδαίας και ΑΕΛ, και θα περιμένει τον αντίπαλο της στην 4η φάση από το ζευγάρι Ιωνικός – Καλλιθέα.
Αναλυτικά το πρόγραμμα της 3ης φάσης:

Τετάρτη 13/9

Πανθρακικός-Εθνικός
Ζάκυνθος-Νίκη Βόλου
Μακεδονικός-Αιγάλεω
Ηλιούπολη-Λεβαδειακός
ΑΟ Χανιώτης-Τηλυκράτης Λευκάδας
Ιωνικός-Καλλιθέα
Απόλλων Παραλιμνίου-Αλεξανδρούπολη
Κοζάνη-Ηρακλής
Αστέρας Σταυρού-Γιούχτας
Παναργειακός-ΠΑΟ Βάρδας
Αχαρναϊκός-Παναχαϊκή

Κυριακή 17/9

Κισσαμικός-Απόλλων Πόντου
Αιολικός-Αναγέννηση Καρδίτσας
ΟΦ Ιεράπετρας-Καμπανιακός ματαιώθηκε
* Ολα τα ματς θα ξεκινήσουν στις 4 μ.μ., εκτός από το Πανθρακικός – Εθνικός που θα ξεκινήσει στις 3 μ.μ.